Profilaktyka w pasiece pomaga ograniczać ryzyko chorób i strat. Obejmuje higienę sprzętu, kontrolę pochodzenia pszczół i monitoring. Ważne są także dobre żywienie oraz wymiana starych plastrów. Nie oznacza rutynowego stosowania leków bez uzasadnienia. Zabiegi powinny odpowiadać rzeczywistym zagrożeniom. Systematyczne działania są skuteczniejsze niż reagowanie dopiero na kryzys.