Bezpieczeństwo żywności w pasiece obejmuje cały proces pozyskiwania produktów. Zaczyna się od odpowiedzialnego stosowania preparatów weterynaryjnych. Obejmuje też higienę miodobrania, sprzętu i pomieszczeń. Ważne są właściwe opakowania oraz warunki magazynowania. Dokumentacja pozwala odtworzyć pochodzenie poszczególnych partii. Kontrola zagrożeń chroni konsumentów i wiarygodność pasieki.